Tomó posesión provisional de la Presidencia de la República, en su calidad de Ministro de Gobernación el 18 de abril de 1893.

El 17 de agosto el Congreso aceptó la renuncia del titular, General Ponciano Leiva, se practicaron elecciones y los resultados favorecieron al General Vásquez, quien recibió constitucionalmente el poder el 15 de septiembre.

Una revuelta armada dio al traste con su administración, cuando las tropas vencedoras, financiadas, armadas y engrosadas con dineros y soldados nicaragüenses, tomaron la plaza de Tegucigalpa el 22 de febrero de 1893 se había proclamado Presidente el doctor Policarpo Bonilla.